长期从事海洋数值模拟与数据同化研究，发表文章70余篇，先后承担了国家自然基金项目、国家973计划、重点研发计划项目和公益性行业专项等多项课题研究。在多变量联合同化调整和高效并行计算等研究方面取得重要成果，基于Kalman滤波原理，通过变量间的协方差表征海洋动力学特征以及多种影响因素之间的相互作用，有效利用观测信息联合优化各种模式变量。发展了海洋全要素高效并行数据同化系统，发布了我国首套全球海洋高分辨率再分析数据。作为核心成员，突破负载近绝对均衡、主从核协同计算框架设计和循环折叠流水线等高效并行关键技术，为海洋数值预报系统建设提供了技术支撑。相关技术成果已应用到21世纪海上丝绸之路海洋环境预报、第二代海洋环境保障等多个预报系统，显著提高了海洋预报能力和气候预测水平，支撑了气候预测和观测设计优化等相关研究的开展。

1. Xunqiang Yin, Junqiang Shi and Fangli Qiao，2018, Evaluation on surface current observing network of high frequency ground wave radars in the Gulf of Thailand, Ocean Dynamics, 68:575–587，doi: 10.1007/s10236-018-1149-5.

2. Xunqiang Yin, Fangli Qiao, Yongzeng Yang, Changshui Xia and Xianyao Chen, 2012, Argo data assimilation in ocean general circulation model of Northwest Pacific Ocean. Ocean Dynamics. 62(7): 1059-1071, doi: 10.1007/s10236-012-0549-1.

3. Xunqiang Yin, Fangli Qiao, Changshui Xia, Xingang LÜ and Yongzeng Yang, 2010, Reconstruction of eddies by assimilating satellite altimeter data into Princeton Ocean Model, Acta Oceanologica Sinica, 29(1): 1-11 , doi: 10.1007/s13131-010-0001-7.

4. Xunqiang Yin, Fangli Qiao, Yongzeng Yang and Changshui Xia. 2010,   An Ensemble adjustment Kalman filter study for Argo data, Chinese Journal of Oceanology and Limnology, 28(3): 625-635, doi: 10.1007/s00343-010-9017-2.

5. Xunqiang Yin, Fangli Qiao and Qi Shu.2011, Using Ensemble Adjustment Kalman Filter to Assimilate Argo Profiles in a Global OGCM. Ocean Dynamics, 61(7): 1017-1031, doi: 10.1007/s10236-011-0419-2.

6. Xunqiang Yin, Lie-Yauw Oey, 2007, Bred-Ensemble Ocean Forecast during Katrina: Loop Current and Ring. Ocean Modelling, 17(4): 300-326, doi: 10.1016/j.ocemod.2007.02.005.

7. Meng Sun, Xunqiang Yin, Yongzeng Yang, Kejian Wu, 2017, An effective method based on dynamic sampling for data assimilation in a global wave model, Ocean Dynamic,, 67:433–449，doi: 10.1007/s10236-017-1030-y.

8. Chengcheng Yu, Yongzeng Yang, Xunqiang Yin, Meng Sun and Yongfang Shi, 2020, Impact of Enhanced Wave-Induced Mixing on the Ocean Upper Mixed Layer during Typhoon Nepartak in a Regional Model of the Northwest Pacific Ocean, Remote Sensing, 12, 2808, doi:10.3390/rs12172808. 

9. Fuwei Wang, Yongzeng Yang, Xunqiang Yin, Xingjie Jiang, Meng Sun, Improving wave modeling performance by incorporating wave-generated turbulence dissipation and improved post-breaking spectrum, Ocean Modelling, 2024, 188, 102311, doi: 10.1016/j.ocemod.2023.102311.

10. Li Liu, Xunqiang Yin, Xueen Chen, 2025, A New EnOI-based Multiscale Assimilation System for Global Ocean Circulation Model, Ocean Modelling, doi: 10.1016/j.ocemod.2025.102551

获奖与荣誉

1. 2020.06，第二代全球浪潮流耦合海洋环境预报系统及应用，海洋工程科学技术奖，特等奖，中国海洋工程咨询协会，排名4/13

2. 2016.02，海洋模式高效并行集合调整卡尔曼滤波同化系统的研发与应用，海洋工程科学技术奖，二等奖，国家海洋局、中国海洋工程咨询协会，排名2/9

3. 2015.03，包含海浪的新型全球气候数值模式的建设与应用，海洋工程科学技术奖，一等奖，国家海洋局、中国海洋工程咨询协会，排名9/12

4. 2016.06，A highly effective global surface wave numerical simulation with ultra-high resolution，戈登贝尔奖入围奖，排名3/12

主持项目

1. 2012-2014，国家自然科学基金，中尺度涡旋在海洋混合中的作用研究（41106032），25万元，主持。

2. 2022-2025，科技部重点专项“全球多尺度、多圈层耦合海洋模式及无缝隙预报系统研发”课题三：区域耦合海洋模式和嵌套技术研制，240万元，课题组长。

3. 2014-2018，国家重点基础研究计划973计划项目课题，岛屿周边海洋动力过程超高分辨率数值模式（2014CB745004），396万元，课题组长。

4. 2015-2018，科技部海洋公益性行业科研专项子任务课题，数据搜集整理与敏感区补充观测（201505013-1），227万元，课题组长。

5. 2018-2020，国家海洋局预报减灾业务运行经费，多源海洋卫星资料同化系统研制与业务应用，125万元，主持。

6. 2021-2022，海洋环境精细化预报模型研发，中海石油（中国）有限公司，233.81万元，主持。

7. 2016-2016，浙江省海洋预警报能力升级改造项目，浪潮流一体化耦合模式开发，90万元，主持。

8. 2023-2024，预报系统同化数据评估与自主同化系统研发，开发项目，303万元，主持。

9. 2024-2025，三个重点海域精细化海洋环境数值预报模型构建，其他项目，616万元，主持。

       10. 2022-2025，区域高分辨率大气-海浪-海洋环流耦合模式发展，青岛海洋科学与技术试点国家实验室“十四五”重大项目“自主海洋与多圈层耦合模式体系发展及应用”第三课题，359万元，主持。